Presedintele Klaus Iohannis a dezvaluit relatia cu Guvernul Ciolos in discursul de investitura a noului ministru al Fondurilor Europene :
“Este, cred, un lucru arhicunoscut că fondurile europene, pe care le poate accesa România, sunt o mare oportunitate pentru noi. Aceste fonduri vin să suplinească resursele noastre în zone vitale, în zone unde, din forţe proprii, nu am putea nici repede, nici profund să restructurăm lucrurile şi să le ducem la bun sfârşit.
Am avut o experiență nu neapărat nefericită, dar o experienţă care ne-a arătat în perioada 2007-2013, că anumite lucruri trebuie rezolvate foarte repede, alte trebuie gândite mult mai profund decât se vede la prima vedere. Eu cred că toată lumea a învăţat ceva din acea etapă bugetară şi toţi cei care ştiu despre ce e vorba se aşteaptă să ne apucăm un pic mai repede de implementat proiectele pentru perioada bugetară în care ne aflăm acum. O parte din munca care trebuia făcută s-a făcut, însă lucrurile, după părerea mea, nu s-au mișcat suficient de repede. Este mai mult decât evident că aceeaşi părere a avut-o şi Prim-ministrul, care a dorit să aibă o echipă cu un suflu nou prin propunerea dumneavoastră.
Ştiţi ce trebuie făcut, ştiţi cu cine trebuie făcut, ştiţi cum trebuie făcut. Eu vă doresc să aveţi suficientă energie să puneţi în practică aceste lucruri. M-am referit acum câteva zile, când am fost la o manifestare foarte frumoasă la Timişoara, o manifestare de cercetare, cu cercetători din țară şi din străinătate, şi am făcut acolo o afirmaţie care nu ştiu dacă a fost foarte bine înţeleasă, cea cu „am ceva nemulţumiri legate de Guvern”. […] Asta a fost una din nemulţumirile mele, că pe zona fondurilor europene lucrurile încă nu s-au mişcat aşa cum probabil ar fi trebuit.
O altă nemulţumire, şi evident că nu am fost singurul care a avut-o, a fost situaţia care s-a creat când s-a lucrat pe un act normativ care ar fi venit să reglementeze salarizarea bugetarilor.
Şi, în fine, o a treia nemulţumire, este, înţeleg, în curs de rezolvare şi s-a referit, evident, la situația de la Operă. Este un contra-exemplu de implicare a unui minister ceea ce s-a întâmplat la Operă. Cred că au rămas puţine greşeli imaginabile care nu au fost făcute de către Ministrul Culturii în această chestiune. Astfel de nemulţumiri le am, le discut cu Prim-ministrul Cioloş şi, după cum se vede, ele se rezolvă. Nu există nemulţumiri care duc la vreun circ între Palate sau la certuri între Preşedinte şi Prim-ministru. Noi lucrăm împreună şi rezolvăm problemele.”